不过在战国时代以后，许多评定众的重要成员都离开平安京回到了自己的领地，因此评定众也变得形同虚设了。
引付众
引付众是评定众的一个辅助机关，主要负责处理诉讼等政务。引付众将全国划分为三个区域至五个区域不等，对应的也分别有三到五组与区域并存的引付众。引付众的长官被称为“头人”，从足利氏一门以及有力大名中提拔，而“头人”下属的引付众则被称为“寄人”。有时候作为引付众“头人”的武士因故不在时，他们的家臣也会作为代理出席引付众执行政务，这时候这些人就被称为“权头人”，表示是代理头人。
政所
室町幕府的政所是幕府管领以及评定众等处理政务的地方。政所的长官被称为“政所执事”，由足利氏重臣伊势氏世袭，政所执事主要管理钱粮借贷等民事诉讼、征税等财务相关政务以及幕府将军家的家事（例如经济开支）等等。政所的副官被称为“政所执事代”，主要由斋藤氏、松田氏两家出任，主管幕府的财库以及金钱的出纳等等。在政所里，还有参加评定处理杂务的政所“寄人”，以及在政所里打杂的下人“公人”。因为政所主管幕府的财政大权，因此政所执事在室町幕府中相当地有地位，政所执事伊势氏在当时也被人称为“阴管领”，足以见得其在幕府中的地位。值得一提的是，政所还有个叫“政所代”的职役，一开始政所代只是政所执事伊势氏私设的职役，在战国时代的文明年间变为公职，由伊势氏的家臣蜷川氏世袭，第一任政所执事代就是《聪明的一休》里的那位傻大个蜷川新佑卫门亲当。
侍所
室町幕府的侍所主要负责统率武士、护卫幕府的各个行政机关、维持平安京的街市治安等等。此外，谋反、抢劫、纵火、斗殴、赌博、强奸等等也都归属侍所管辖，总体来说就是平安京的警察局。侍所的长官被称为“侍所所司”，早先由今川氏、细川氏等足利氏一门出任，后来逐渐由山名氏、赤松氏、一色氏、京极氏四家幕府重臣轮流担任，这四个家族也被称为“四职”。在室町幕府中后期，侍所所司开始兼任平安京所在的山城国守护，山城国内的公田私田、寺社、治安、行政等等也都由侍所所司掌管。与政所执事代一样，侍所所司的家臣也可以出任侍所所司代，作为所司的辅助职役。侍所的公务员被称为“检断”，这个职役相当于现在的检察官，负责维持治安，有时也会处理一些本由政所管理的一些财政相关的民事诉讼。侍所以下，还有个被称为小侍所的机关，小侍所作为侍所的辅助机构，主要负责选定宿卫幕府机关的人选等等，在战国时代以后，职权逐渐扩大到同侍所相当。
问注所
问注所一开始是负责审判领地争端以及遗失物品、赃物的诉讼，后来因为这类案件都由侍所管理，问注所逐渐变成负责记录案件以及管理证券的机构。问注所的长官被称为“问注所执事”，因为由町野氏、太田氏两家评定众兼任，因此也被称为问注所执事代、问注所代。
奈良奉行
奈良位于大和国，此地有着藤原氏的族寺兴福寺等寺院，曾经是日本的旧京。自古以来，大和国就被视为是抵抗朝廷的“圣地”，壬申之乱时，大海人皇子就逃到了大和国起兵。到了南北朝时期，后醍醐天皇也逃到了大和国建立南朝，与占据京都的“北朝”对立。正是因此，大和国对于室町幕府来说也是一个十分重要的都市，室町幕府在奈良设立了“奈良奉行”，负责维护治安以及处理诉讼。在进入战国时代以后，奈良所在的大和国逐渐落入了畠山氏与细川氏的手中，在两家衰弱以后，大和国诸寺林立，成为了三好氏、松永氏的地盘。
守护
按照律令制的规定来看，朝廷本来在各个令制国设立有国司“守”，守由朝廷指派，任期为四年，基本上我们在历史书上看到的“xx守”便是指国司的官名。不过，在这里就得提提，有一个特别容易让日本史初学者搞混的东西——在室町幕府的制度里，各国都有设立一个“守护”职役，“守护”与“守”，看似只有一字之差，实则有着天壤之别。守护最早脱胎于平安时代末期平家“总官政权”下的“追捕使”制度，在镰仓幕府时期改为“守护”，负责统率一国御家人作战等事务。然而，在镰仓幕府末期、南北朝初期，守护势力抬头，尤其是室町幕府颁布的“半济令”，让守护掌握了一国的行政、军事、经济大权，并且守护职役是可以世袭的，各国的守护俨然成为了一个个割据一方的诸侯。等到室町幕府将南北朝统一以后，才发现幕府的重臣们已经变成了少则领有半国、一国，多则领有数国的割据势力，尤其是“四职”之一的山名氏，在山名氏清时代以及山名宗全时代，领有十国左右的山名氏一族简直就是一个足以威胁幕府的超级大名。
守护代
在进入战国时代以前，室町幕府为了防止这些领有数国守护职役的大名在地方做大，因此命令大多数守护留在京都，参与幕政，称为“守护在京制”。那么，守护如果留在京都的话，地方自然不能没有人管理，于是，守护的家臣们便代替自己的主公管理起了领国，这些代理者
《本章未完，点击下一页》